Blue Moment kể về nhóm chuyên viên phòng chống thiên tai cấp độ đặc biệt chuyên đứng đầu chiến tuyến, bảo vệ người dân khỏi thảm họa thiên nhiên. Cô nàng Kumota Aya là một "lính mới" của nhóm, trước đó đã bị đuổi việc vì tính cách khó chịu. Tại chỗ làm mới, cô được dịp hợp tác với nhà nghiên cứu Haruhara Kankuro vừa tài giỏi vừa đẹp trai, có danh xưng "Hoàng tử mây".