Lấy bối cảnh tại một thành phố hư cấu nơi có Ga Kasaki, có một truyền thuyết đô thị về "Đường hầm Urashima", một đường hầm có khả năng thực hiện điều ước của một người—nhưng phải trả giá. Kaoru Touno là một học sinh trung học ở một thị trấn nông thôn ở Nhật Bản, sống khép kín và về nhà mỗi ngày trên tuyến tàu Oosara-Sugimori. Một ngày mưa, Kaoru gặp Anzu Hanashiro bị ướt sũng ở ga xe lửa. Kaoru cố gắng đưa cho cô chiếc ô của mình, trong đó cô tiết lộ rằng mình không có cha mẹ, điều mà Kaoru nói với cô là "điều đó thật là tốt". Anzu nhận chiếc ô và họ trao đổi số điện thoại. Từ đây mối quan hệ cũng như tình cảm của hai cô cậu nảy sinh và câu chuyện bắt đầu. Cứ 3 giây trong đường hầm này tương đương với 2 giờ ở bên ngoài.