Vào ngày cuối cùng của kì nghỉ hè, lúc Nobita chán nản, Doraemon đã sử dụng bảo bối “Thảm câu cá trong nhà” để câu cá ở vùng biển phía Nam Thái Bình Dương. Nobita đã câu được một tảng đá kỳ lạ nên đã dùng “Khăn trùm thời gian” giúp tảng đá khôi phục lại nguyên trạng. Tảng đá này là sáo Ocarina. Khi Nobita bắt đầu thổi sáo Ocarina, một con cá voi xanh lớn đã nhảy lên khỏi mặt nước và xuyên thủng mái nhà. Doraemon lập tức dùng đèn pin thu nhỏ cá voi lại và đèn pin khôi phục trước khi gặp rắc rối to. Sau đó sử dụng thức ăn vật nuôi khiến cá voi có thể tự do bay lơ lửng. Doraemon đã nói với nhóm Nobita rằng mình kiểm tra sáo Ocarina và hóa ra ra nó có thể phát ra một sóng âm với tần số đặc biệt – 52 Hertz. Điều này chứng tỏ bé cá voi này chính là “cá voi đơn độc nhất thế giới” vì ocarina có thể gọi bé cá voi. Cả nhóm đã phát hiện cả Ocarina và bé cá voi xuất hiện từ 7000 năm trước. Tại sao Ocarina và cá voi có thể tồn tại lâu như vậy? Và đến từ đâu? Cách duy nhất để làm sáng tỏ bí ẩn này là đi đến niên đại 7000 năm trước. Cả nhóm đã đi đến 7000 năm trước bằng “cỗ máy thời gian”. Sau đó, họ tìm thấy một hòn đảo có con người sinh sống với một nền văn minh rất phát triển. Cả nhóm Nobita lên đảo đã làm quen được với cậu bé thiên tài Pito và cô bé Nana. Cậu bé Pito này chính là chủ nhân của sáo Ocarina, Gonnie – tên của bé cá voi – cũng là một người bạn thân quan trọng của Pito. Vì sao hòn đảo này phát triển như vậy? Vì sao 7000 năm sau nó đã biến mất? Để biết rõ thêm cuộc phiêu lưu của nhóm Nobita ở vùng biển phía Nam bạn hãy xem “Cá voi và hòn đảo ống huyền ảo”.