Phim Chiến Dịch Lăng Xê Nobuta kể về tình bạn giữa Kotani Nobuko (Nobuta), một học sinh nhút nhát, lặng lẽ luôn cam chịu để người khác bắt nạt mình, và hai cậu học sinh với tính tình hoàn toàn trái ngược nhau – Kiritani Shuuji và Kusano Akira – cùng sự trưởng thành của họ, bên cạnh nhau. Khi Nobuko chuyển về trường mới, cô vẫn tiếp tục bị những nữ sinh hung dữ trong lớp bắt nạt và trêu ghẹo vì sự lập dị của mình. Chứng kiến Nobuko bị bắt nạt, Shuuji và Akira quyết định giúp đỡ Nobuta và lập một kế hoạch bí mật khiến Nobuta trở thành nữ sinh nổi tiếng nhất trường – không hoàn toàn vì lòng tốt mà vì theo họ, đây là việc chưa ai từng làm qua và sẽ là một điều đáng làm để tận hưởng hết tuổi trẻ. Với sự giúp đỡ của Shuuji và Akira, Nobuta không còn cảm thấy cô đơn và dần dần hòa nhập được với thế giới xung quanh, với những người bạn trong lớp, bắt đầu biết cười.